이번달은 여러 가지로 굉장히 (짜증나면서도) 재미있는 달이다. 그 이유 중 하나로,하나로, 품격과 전통의(...) PRL이 드디어 100호를 내놓았다. 100호의 상징성 때문인지, 제목만 봐도봐도 읽어 보고 싶은 논문들이 여럿 있다. 몇몇 논문들은 주제가 요새 관심사와관심사와 꽤 관심이 있어서 읽어보는 중.
* M. A. Bettencourt,Bettencourt, Vadas Gintautas, and Michael I. Ham. 'Identification of Functional InformationInformation Subgraphs in Complex Networks,' Phys.Rev.Lett. 100, 238701 (2008)
Information subgraph에 대한 공부다. 내 주요 주제는 아니지만,아니지만, 황은진씨와 이운철 박사님의 최근 관심사와 굉장히 겹치는 부분이 많고, 두 분이분이 곧 낼 예정인 논문의 주제와 수학적인 궤를 같이하는 부분이 있다. 이쪽이쪽 연구는 Shannon entropy에 기반한다는 것과, information flow에 대한 몇가지 동의점을 제외한제외한 부분에 대해서 아직 합의가 이루어지지 않아서 논문을 보다 보면 가끔 혼란스럽다.혼란스럽다.
주로 information theory쪽과 bionetwork 연구쪽으로 많이 진행이 되어 있다. InformationInformation theory는 찾아보면 굉장히 많이 되어 있어서 딱히 언급할 필요는 없을듯. 수학적으로수학적으로 접근하기 위해서는 얼마전 연구실 스터디에서 리뷰한 N Ay, D Polani. 'Information flows in causal networks,' Adv Compl Syst. In press.press. Santa Fe Institute Working Paper (2007) 가 흥미있었다.
생명생명 현상쪽으로 관심이 있는 경우 Hualou Liang, Mingzhou Ding, Steven L. Bressler.Bressler. 'Temporal dynamics of information flow in the cerebral cortex,' Neurocomputing 38-40 (2001) 1429~1435 가 좋은 시작점인듯. 뒤의 연구들을 이해하기 위해서 너무 앞도 아니고 너무 뒤도 아닌 지점의 논문이다.
* Lazaros K. Gallos, Chaoming Song, and Herna´n A. Makse.Makse. 'Scaling of Degree Correlations and Its Influence on Diffusion inin Scale-Free Networks,' Phys.Rev.Lett. 100, 248701 (2008)
네트워크 위에서의 Fractal dimension을 재는 것 부터 꾸준히꾸준히 해오던 '그' 그룹의 논문. Degree correlation에 관한 이야기인데, 네트워크의 토폴로지를 어떻게 그룹화하느냐에 대한 고민에 대한 또 하나의 답안지이다. Correlation strength가 diffusion과 강하게 연관되어 있다는 결론을 내면서, Diffusion을 다루면서 항상 함께 언급되는 synchronization이나 robustness 에 대해서도 이야기가 가능한 접근법이라는 이야기 (이지만, 가지고 있는걸로 하나 간단하게 돌려보니 해석이 힘든 결과가 나왔다)로 마무리. SO 까지는 다루지 않은 것이 대인의 풍모? 랄까. (보통 덤벼보는 -그렇지만 딱히 답이 나오지는 않는- 문제라...)
* J. Herna´ndez-Rojas and J. M. Gomez Llorente. 'Microcanonical versus Canonical Analysis of Protein Folding' Phys.Rev.Lett. 100, 258104 (2008)
제목때문에 땡겨서 어제 새벽에 잡은건데, 매우 사전지식을 요하는 부분이 많아서 느릿느릿 보는 중. 분명 익숙한 말들인데 주어가 전부 생소해서 걍 접을까 싶기도 한데, 어차피 시뮬레이션 돌아가는 시간이 걸리니 외로운 밤 텍스트큐브와 이 논문을 서로 짜증날 때마다 번갈아가며 읽어보련다.
그러고보니 이번호는 의외로 네트워크 쪽에서 읽고 싶은 논문들이 좀 있는듯?