Mind Forest: Beneath imaginations: 논문 태그 글 목록https://forest.nubimaru.com/시간의 토양에 기억의 나무를 심으며2024-03-29T18:27:11+09:00Textcube 1.10.10 : Tempo primo근황inureyeshttps://forest.nubimaru.com/entry/life-on-the-end-of-october2008-10-28T13:59:40+09:002008-10-28T13:58:19+09:00<p>어제 석범의 말이 생각나서 근황 보고.</p>
<p>*</p>
<p>(법적으로) 유부남이 되었다. 대학원생 아파트를 신청하기 위한 서류 중 '혼인 증명서' 가 있다.</p>
<p>혼인 신청서 내는데 필요하다고 명기 되어있는 서류들은 전부 필요하지 않았다. (신분증만 있으면 되더라는...) 웹을 검색한 후 찾아본 안내에 따라 서류 준비하려고 이리저리 분주했던 것을 떠올리니 솔직히 억울했다. 세상이 바뀌는 속도만큼 웹 위의 정보 갱신이 빠르지는 않았다.</p>
<p>*</p>
<p>작업용 컴퓨터를 구입했다. 맥북 에어는 예전에 <a title="로우엔드 맥북프로" href="/entry/macbook-air-review">로우엔드 맥북프로</a> 라고 표현할 정도로 괜찮은 컴퓨터이지만, 복잡하고 CPU 의존적인 작업 (텍스트큐브 개발 환경이나 클러스터에 얹기 전의 시뮬레이션 프로그램 제작등) 을 위해서는 '하이엔드'가 필요하다는 점을 깨닫게 되었다. 맥북 에어 단독으로는 무리가 있었달까.</p>
<p>iMac과 맥북 프로 사이에서 고민하다가 맥북 프로로 결정하고 구입하였다. 24인치 아이맥도 좋지만, 고정된 놓아둘 곳이 마땅찮았다. 기숙사와 연구실을 종종 오가야 하는 점도 있어서 이동성이 있는 것으로 결정하였다. 2.4Ghz Core 2 Duo, 4GB, 17인치, 200기가 하드디스크의 적당한 사양. 가로 1920px 의 고해상도 모니터라 들어가는 정보는 많은데 글씨가 너무 작아 보인다는 점이 문제. 쓰다보면 익숙해 지겠지 싶다.</p>
<p>*</p>
<p>웹 어플리케이션 컨퍼런스 2008과 한국 물리학회 추계 학술대회에 참석했다. 두 컨퍼런스 모두 재미있는 시간이었다. 아쉬움도 많이 남았다. 전자의 경우는 간만에 모인 구성원들과 '건설적인' 이야기를 못 했다는 점이 아쉽고, 후자의 경우는 발표를 반 정도 못 들었다는 점이 아쉽다.</p>
<p>*</p>
<p>죽죽 연기되는 텍스트큐브 1.7.6 의 (아마도) 마지막 발표후보가 오늘로 다가왔다. (사실 공개했다가 문제 발견되어서 급 비공개를...) 이건 그라피티에님으로부터 최종 신호 오면 정리해서 공개할 예정. 1.8과 2.0 트리는 근본적인 부분에서 많은 생각을 하게 만들고 있다. PHP에 얼마만큼의 프레임웍이 필요한가? PHP 위의 프레임웍이 개발자의 창의성을 제한한다는 말에 반박할 수 있을까?</p>
<p>*</p>
<p>그리고 이제 7일동안 논문 두 개를 마무리해야 하는 때가 왔다는. (하나는 오늘 마무리!)</p>
<fieldset style="margin:20px 0px 20px 0px;padding:5px;"><legend><span><strong>크리에이티브 커먼즈 라이센스</strong></span></legend><!--Creative Commons License--><div style="float: left; width: 88px; margin-top: 3px;"><a rel="license" href="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.0/kr/" target=_blank><img alt="Creative Commons License" style="border-width: 0" src="http://i.creativecommons.org/l/by-nc-nd/2.0/kr/88x31.png"/></a></div><div style="margin-left: 92px; margin-top: 3px; text-align: justify;">이 저작물은 <a rel="license" href="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.0/kr/" target=_blank>크리에이티브 커먼즈 코리아 저작자표시-비영리-변경금지 2.0 대한민국 라이센스</a>에 따라 이용하실 수 있습니다.
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<pre><code>* M. A. Bettencourt,Bettencourt, Vadas Gintautas, and Michael I. Ham. 'Identification of Functional InformationInformation Subgraphs in Complex Networks,' Phys.Rev.Lett. 100, 238701 (2008)
</code></pre>
<p>Information subgraph에 대한 공부다. 내 주요 주제는 아니지만,아니지만, 황은진씨와 이운철 박사님의 최근 관심사와 굉장히 겹치는 부분이 많고, 두 분이분이 곧 낼 예정인 논문의 주제와 수학적인 궤를 같이하는 부분이 있다. 이쪽이쪽 연구는 Shannon entropy에 기반한다는 것과, information flow에 대한 몇가지 동의점을 제외한제외한 부분에 대해서 아직 합의가 이루어지지 않아서 논문을 보다 보면 가끔 혼란스럽다.혼란스럽다.</p>
<p>주로 information theory쪽과 bionetwork 연구쪽으로 많이 진행이 되어 있다. InformationInformation theory는 찾아보면 굉장히 많이 되어 있어서 딱히 언급할 필요는 없을듯. 수학적으로수학적으로 접근하기 위해서는 얼마전 연구실 스터디에서 리뷰한 N Ay, D Polani. 'Information flows in causal networks,' Adv Compl Syst. In press.press. Santa Fe Institute Working Paper (2007) 가 흥미있었다.</p>
<p>생명생명 현상쪽으로 관심이 있는 경우 Hualou Liang, Mingzhou Ding, Steven L. Bressler.Bressler. 'Temporal dynamics of information flow in the cerebral cortex,' Neurocomputing 38-40 (2001) 1429~1435 가 좋은 시작점인듯. 뒤의 연구들을 이해하기 위해서 너무 앞도 아니고 너무 뒤도 아닌 지점의 논문이다.</p>
<pre><code>* Lazaros K. Gallos, Chaoming Song, and Herna´n A. Makse.Makse. 'Scaling of Degree Correlations and Its Influence on Diffusion inin Scale-Free Networks,' Phys.Rev.Lett. 100, 248701 (2008)
</code></pre>
<p>네트워크 위에서의 Fractal dimension을 재는 것 부터 꾸준히꾸준히 해오던 '그' 그룹의 논문. Degree correlation에 관한 이야기인데, 네트워크의 토폴로지를 어떻게 그룹화하느냐에 대한 고민에 대한 또 하나의 답안지이다. Correlation strength가 diffusion과 강하게 연관되어 있다는 결론을 내면서, Diffusion을 다루면서 항상 함께 언급되는 synchronization이나 robustness 에 대해서도 이야기가 가능한 접근법이라는 이야기 (이지만, 가지고 있는걸로 하나 간단하게 돌려보니 해석이 힘든 결과가 나왔다)로 마무리. SO 까지는 다루지 않은 것이 대인의 풍모? 랄까. (보통 덤벼보는 -그렇지만 딱히 답이 나오지는 않는- 문제라...)</p>
<pre><code>* J. Herna´ndez-Rojas and J. M. Gomez Llorente. 'Microcanonical versus Canonical Analysis of Protein Folding' Phys.Rev.Lett. 100, 258104 (2008)
</code></pre>
<p>제목때문에 땡겨서 어제 새벽에 잡은건데, 매우 사전지식을 요하는 부분이 많아서 느릿느릿 보는 중. 분명 익숙한 말들인데 주어가 전부 생소해서 걍 접을까 싶기도 한데, 어차피 시뮬레이션 돌아가는 시간이 걸리니 외로운 밤 텍스트큐브와 이 논문을 서로 짜증날 때마다 번갈아가며 읽어보련다.</p>
<p>그러고보니 이번호는 의외로 네트워크 쪽에서 읽고 싶은 논문들이 좀 있는듯?</p>
<fieldset style="margin:20px 0px 20px 0px;padding:5px;"><legend><span><strong>크리에이티브 커먼즈 라이센스</strong></span></legend><!--Creative Commons License--><div style="float: left; width: 88px; margin-top: 3px;"><a rel="license" href="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.0/kr/" target=_blank><img alt="Creative Commons License" style="border-width: 0" src="http://i.creativecommons.org/l/by-nc-nd/2.0/kr/88x31.png"/></a></div><div style="margin-left: 92px; margin-top: 3px; text-align: justify;">이 저작물은 <a rel="license" href="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.0/kr/" target=_blank>크리에이티브 커먼즈 코리아 저작자표시-비영리-변경금지 2.0 대한민국 라이센스</a>에 따라 이용하실 수 있습니다.
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<div class="imageblock center" style="text-align: center; clear: both;"><img src="https://forest.nubimaru.com/cache/thumbnail/7/1104615919.w450-h426.jpg" width="450" height="426" alt="Tree structure of AEC"/><p class="cap1">이걸 이상하게 보는 법을 가지고 노는 중.</p></div><fieldset style="margin:20px 0px 20px 0px;padding:5px;"><legend><span><strong>크리에이티브 커먼즈 라이센스</strong></span></legend><!--Creative Commons License--><div style="float: left; width: 88px; margin-top: 3px;"><a rel="license" href="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.0/kr/" target=_blank><img alt="Creative Commons License" style="border-width: 0" src="http://i.creativecommons.org/l/by-nc-nd/2.0/kr/88x31.png"/></a></div><div style="margin-left: 92px; margin-top: 3px; text-align: justify;">이 저작물은 <a rel="license" href="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.0/kr/" target=_blank>크리에이티브 커먼즈 코리아 저작자표시-비영리-변경금지 2.0 대한민국 라이센스</a>에 따라 이용하실 수 있습니다.
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